Det blev Sebastian Vettel, der tog pole position, og dermed fulgte op på resultaterne fra træningerne.
I Q3 var det som sædvanligt de HRT, og Marussia der blev slået ud sammen med Caterham – trods Heikki Kovalainen kun var godt 0,3 sekunder fra at have klaret sig videre. Bruno Senna blev lidt overraskende den sidste kører, der heller ikke klarede sig videre. Han brokkede sig noget over at have fået ødelagt sin omgang af Jean-Eric Vergne, og efter løbet modtog franskmanden da også en straf på tre placeringer til søndagens startgrid.
I Q2 viste Red Bull, McLaren Massa for Ferrari fra start af hurtige tider, og flere af tiderne kom under de 1:32.000.
Sebastian Vettel endte med at blive hurtigste kører i Q2 med en tid på1:31.501. Tyskeren kom ind foran Jenson Button, og Kimi Räikkönen rejste sig fra træningerne og kom ind i tredjebedste tid. Fernando Alonso kom ind som nummer fire i Ferrarien, og Kamui Kobayashi imponerede på hjemmebanen med femtebedste tid. Herefter fulgte Webber, Grosjean, Hamilton, Perez og Hülkenberg som tiende og sidste kører i Q2.
I Q2 blev Michael Schumacher længe i pitten og kom først ud inden for de sidste minutter, men det rakte hverken for ham eller Nico Rosberg at komme videre til sidste del af kvalifikationen.
I Q3 viste Red Bull sig også fra start – Sebastian Vettel med en tid på 1:30.839! Men det var i de sidste par minutter at startopstillingen rigtig blev afgjort.
Kimi Räikkönen pressede Lotus-raceren for meget og spandt af, men uden at beskadige bilen. Men det betød flere kørere måtte afbryde deres sidste omgang, som de ellers var på ud på. Det er risikoen ved at vente til det allersidste.
Sebastian Vettel’s tid rakte til pole position, og Mark Webber blev P2 – et godt resultat af Red Bull, der dermed fulgte op på de flotte resultater fra træningerne. Det er i øvrigt Sebastian Vettel’s 34. pole position.
Jenson Button blev nummer tre, men rykkes til løbet fem pladser tilbage på grund af han har skiftet gearkasse, og starter dermed som otter. Kamui Kobayashi opnåede P4, men starter treer, og P5 til Romain Grosjean, der så starter firer til løbet. Sergio Perez blev P6 og starter femmer, og efter ham kommer Fernando Alonso.
Nico Hülkenberg kom ind som P10, men han må skifte gearkasse til løbet, og derved kommer Felipe Massa op i top 10, trods han ikke nåede Q3.
Nu fik flere af kørerne ikke kørt deres sidste omgang færdig, fordi der kom gult flag, da Räikkönen spandt af, men faktum er, at Red Bull ser meget hurtige ud på Suzuka. Så det kan meget vel være den rette strategi, der skal til for at Fernando Alonso, Lewis Hamilton og Kimi Räikkönen kan køre med om sejren i Japan.
Søndag morgen klokken 8:00 dansk tid går starten til Japans Grand Prix.
Resultatet af kvalifikationen:
| 1 | Sebastian Vettel | Red Bull Racing-Renault | 1:32.608 | 1:31.501 | 1:30.839 |
| 2 | Mark Webber | Red Bull Racing-Renault | 1:32.951 | 1:31.950 | 1:31.090 |
| 3 | Jenson Button | McLaren-Mercedes | 1:33.077 | 1:31.772 | 1:31.290 |
| 4 | Kamui Kobayashi | Sauber-Ferrari | 1:32.042 | 1:31.886 | 1:31.700 |
| 5 | Romain Grosjean | Lotus-Renault | 1:32.029 | 1:31.988 | 1:31.898 |
| 6 | Sergio Perez | Sauber-Ferrari | 1:32.147 | 1:32.169 | 1:32.022 |
| 7 | Fernando Alonso | Ferrari | 1:32.459 | 1:31.833 | 1:32.114 |
| 8 | Kimi Räikkönen | Lotus-Renault | 1:32.221 | 1:31.826 | 1:32.208 |
| 9 | Lewis Hamilton | McLaren-Mercedes | 1:33.061 | 1:32.121 | 1:32.327 |
| 10 | Nico Hulkenberg | Force India-Mercedes | 1:32.828 | 1:32.272 | |
| 11 | Felipe Massa | Ferrari | 1:32.946 | 1:32.293 | |
| 12 | Paul di Resta | Force India-Mercedes | 1:32.898 | 1:32.327 | |
| 13 | Michael Schumacher | Mercedes | 1:33.349 | 1:32.469 | |
| 14 | Pastor Maldonado | Williams-Renault | 1:32.834 | 1:32.512 | |
| 15 | Nico Rosberg | Mercedes | 1:33.015 | 1:32.625 | |
| 16 | Daniel Ricciardo | STR-Ferrari | 1:33.059 | 1:32.954 | |
| 17 | Jean-Eric Vergne | STR-Ferrari | 1:33.370 | 1:33.368 | |
| 18 | Bruno Senna | Williams-Renault | 1:33.405 | ||
| 19 | Heikki Kovalainen | Caterham-Renault | 1:34.657 | ||
| 20 | Timo Glock | Marussia-Cosworth | 1:35.213 | ||
| 21 | Pedro de la Rosa | HRT-Cosworth | 1:35.385 | ||
| 22 | Charles Pic | Marussia-Cosworth | 1:35.429 | ||
| 23 | Vitaly Petrov | Caterham-Renault | 1:35.432 | ||
| 24 | Narain Karthikeyan | HRT-Cosworth | 1:36.734 |



